V průběhu toho či onoho problému se objeví jakýkoli druh zařízení, problém není hrozný, klíčem je správný způsob, jak ho vyřešit. Níže stručně představíme běžné problémy a řešení několika retortií.

1. Vzhledem k nesprávné hladině vody, vysoké nebo nízké teplotě vody, poruše odvodnění atd. je nutné přijmout správné metody čištění podle různých problémů.

2. Těsnicí kroužek je stárnoucí, netěsný nebo poškozený. Před použitím je nutná pečlivá kontrola a včasná výměna těsnicího kroužku. V případě poškození by měl obsluha rozhodně jednat nebo těsnicí kroužek vyměnit za předpokladu zajištění bezpečné teploty a tlaku.

3. Náhlý výpadek proudu nebo plynu V takové situaci pečlivě sledujte provozní stav retorty, zaregistrujte ji a po obnovení dodávky plynu dokončete sterilizaci. Pokud je dodávka plynu přerušena na delší dobu, je třeba vyjmout produkty z retorty, uložit je a poté pokračovat v práci, dokud se dodávka neobnoví.